Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg2aQ6P4T0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atg2aQ6P4T0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg2aQ6P4T0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atg2aQ6P4T0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms