Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNCKQ6P2M8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNCKQ6P2M8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PNCKQ6P2M8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms