Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrimpolQ6P1E7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrimpolQ6P1E7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PrimpolQ6P1E7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrimpolQ6P1E7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms