Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zmiz1Q6P1E1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zmiz1Q6P1E1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zmiz1Q6P1E1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms