Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Slx4Q6P1D7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Slx4Q6P1D7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Slx4Q6P1D7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Slx4Q6P1D7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Slx4Q6P1D7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Slx4Q6P1D7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms