Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWSAP1Q6NVH7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWSAP1Q6NVH7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWSAP1Q6NVH7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SWSAP1Q6NVH7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SWSAP1Q6NVH7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SWSAP1Q6NVH7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SWSAP1Q6NVH7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SWSAP1Q6NVH7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms