Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP4R4Q6NUP7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP4R4Q6NUP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP4R4Q6NUP7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP4R4Q6NUP7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms