Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
APOBEC3HQ6NTF7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
APOBEC3HQ6NTF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
APOBEC3HQ6NTF7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms