Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE12Q6L8Q7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE12Q6L8Q7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE12Q6L8Q7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE12Q6L8Q7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms