Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 BTNL9-203ENST00000491209 2199 ntTSL 211.62□□□□□ -0.558e-9■■■■□ 24.1
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NIPBLQ6KC79 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.244e-14■■■■□ 24
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NIPBLQ6KC79 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 23.9
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NIPBLQ6KC79 DDX39B-212ENST00000456662 932 ntTSL 512.06□□□□□ -0.483e-23■■■■□ 23.3
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NIPBLQ6KC79 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-23■■■■□ 23.3
NIPBLQ6KC79 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.173e-23■■■■□ 23.3
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NIPBLQ6KC79 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 23.3
NIPBLQ6KC79 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.032e-6■■■■□ 23.3
NIPBLQ6KC79 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 23.3
NIPBLQ6KC79 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 32.92□□□□□ -1.943e-7■■■■□ 23.3
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