Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med13lQ6JPI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Med13lQ6JPI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Med13lQ6JPI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms