Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYW3Q6IPR3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TYW3Q6IPR3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TYW3Q6IPR3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms