Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARL6IP4Q66PJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARL6IP4Q66PJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ARL6IP4Q66PJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARL6IP4Q66PJ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms