Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hist2h2beQ64524 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hist2h2beQ64524 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.7 ms