Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Top2bQ64511 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Top2bQ64511 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Top2bQ64511 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Top2bQ64511 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Top2bQ64511 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Top2bQ64511 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms