Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Clcn1Q64347 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Clcn1Q64347 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clcn1Q64347 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clcn1Q64347 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Clcn1Q64347 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms