Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ddr2Q62371 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddr2Q62371 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddr2Q62371 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddr2Q62371 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms