Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
Kdm5dQ62240 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC42.5■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.45■■■■■ 4.39
Kdm5dQ62240 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Kdm5dQ62240 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Kdm5dQ62240 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC42.3■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
Kdm5dQ62240 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Kdm5dQ62240 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms