Protein–RNA interactions for Protein: Q62191

Trim21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim21Q62191 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim21Q62191 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim21Q62191 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim21Q62191 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim21Q62191 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.9 ms