Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Npm1Q61937 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Npm1Q61937 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Npm1Q61937 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Npm1Q61937 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Npm1Q61937 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Npm1Q61937 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Npm1Q61937 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms