Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Itga6Q61739 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Itga6Q61739 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Itga6Q61739 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Itga6Q61739 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms