Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BcanQ61361 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BcanQ61361 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BcanQ61361 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BcanQ61361 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BcanQ61361 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BcanQ61361 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BcanQ61361 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BcanQ61361 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BcanQ61361 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BcanQ61361 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BcanQ61361 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BcanQ61361 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BcanQ61361 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BcanQ61361 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms