Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcd2Q61285 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcd2Q61285 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd2Q61285 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd2Q61285 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms