Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NinQ61043 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NinQ61043 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NinQ61043 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinQ61043 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinQ61043 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinQ61043 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinQ61043 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NinQ61043 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NinQ61043 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NinQ61043 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NinQ61043 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NinQ61043 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinQ61043 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinQ61043 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NinQ61043 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NinQ61043 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NinQ61043 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NinQ61043 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinQ61043 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NinQ61043 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinQ61043 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinQ61043 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NinQ61043 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NinQ61043 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinQ61043 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinQ61043 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinQ61043 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinQ61043 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NinQ61043 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinQ61043 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinQ61043 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinQ61043 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NinQ61043 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinQ61043 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinQ61043 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinQ61043 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NinQ61043 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NinQ61043 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NinQ61043 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NinQ61043 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NinQ61043 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NinQ61043 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NinQ61043 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NinQ61043 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NinQ61043 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NinQ61043 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinQ61043 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinQ61043 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinQ61043 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinQ61043 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinQ61043 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinQ61043 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NinQ61043 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NinQ61043 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NinQ61043 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NinQ61043 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NinQ61043 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NinQ61043 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NinQ61043 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NinQ61043 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NinQ61043 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NinQ61043 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NinQ61043 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NinQ61043 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NinQ61043 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NinQ61043 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NinQ61043 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NinQ61043 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NinQ61043 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NinQ61043 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NinQ61043 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NinQ61043 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NinQ61043 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NinQ61043 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NinQ61043 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NinQ61043 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NinQ61043 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NinQ61043 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NinQ61043 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NinQ61043 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NinQ61043 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NinQ61043 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NinQ61043 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NinQ61043 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinQ61043 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinQ61043 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinQ61043 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinQ61043 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinQ61043 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinQ61043 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NinQ61043 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.6 ms