Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd6Q61003 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd6Q61003 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd6Q61003 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms