Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mkrn3Q60764 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mkrn3Q60764 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mkrn3Q60764 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mkrn3Q60764 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms