Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epha1Q60750 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epha1Q60750 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Epha1Q60750 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Epha1Q60750 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms