Protein–RNA interactions for Protein: Q60680

Chuk, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChukQ60680 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChukQ60680 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ChukQ60680 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChukQ60680 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ChukQ60680 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ChukQ60680 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ChukQ60680 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChukQ60680 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChukQ60680 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChukQ60680 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChukQ60680 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChukQ60680 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChukQ60680 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChukQ60680 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChukQ60680 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChukQ60680 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChukQ60680 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChukQ60680 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChukQ60680 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms