Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF90

Atp13a4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a4Q5XF90 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp13a4Q5XF90 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Atp13a4Q5XF90 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atp13a4Q5XF90 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms