Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp13a3Q5XF89 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp13a3Q5XF89 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp13a3Q5XF89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp13a3Q5XF89 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms