Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AGAP9Q5VTM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGAP9Q5VTM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms