Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc125Q5U465 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc125Q5U465 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc125Q5U465 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms