Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00242Q5T6M2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00242Q5T6M2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00242Q5T6M2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms