Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2Q4

CCNYL2, Cyclin-Y-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL2Q5T2Q4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNYL2Q5T2Q4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNYL2Q5T2Q4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNYL2Q5T2Q4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms