Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C10orf55Q5SWW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
C10orf55Q5SWW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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