Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arhgap44Q5SSM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgap44Q5SSM3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgap44Q5SSM3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgap44Q5SSM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms