Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM48Q5RL73 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBM48Q5RL73 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RBM48Q5RL73 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RBM48Q5RL73 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms