Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trdv2-2Q5R1A4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trdv2-2Q5R1A4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trdv2-2Q5R1A4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms