Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rtp3Q5QGU6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtp3Q5QGU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms