Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SGO2Q562F6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SGO2Q562F6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms