Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC3BQ53EP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC3BQ53EP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC3BQ53EP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC3BQ53EP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC3BQ53EP0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC3BQ53EP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FNDC3BQ53EP0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FNDC3BQ53EP0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FNDC3BQ53EP0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms