Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ankrd28Q505D1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd28Q505D1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd28Q505D1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms