Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1qtnf9Q4ZJN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1qtnf9Q4ZJN1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1qtnf9Q4ZJN1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms