Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC9B1Q4ZJI4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC9B1Q4ZJI4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC9B1Q4ZJI4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms