Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Afg1lQ3V384 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Afg1lQ3V384 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Afg1lQ3V384 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Afg1lQ3V384 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms