Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BC051142Q3V0M8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BC051142Q3V0M8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC051142Q3V0M8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BC051142Q3V0M8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms