Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pls1Q3V0K9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pls1Q3V0K9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pls1Q3V0K9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms