Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU96

Cdc42bpa, Serine/threonine-protein kinase MRCK alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpaQ3UU96 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cdc42bpaQ3UU96 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Cdc42bpaQ3UU96 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Cdc42bpaQ3UU96 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdc42bpaQ3UU96 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cdc42bpaQ3UU96 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 723.7 ms