Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim15Q3UTD9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim15Q3UTD9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim15Q3UTD9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim15Q3UTD9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms