Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31aQ3UPL0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sec31aQ3UPL0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31aQ3UPL0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sec31aQ3UPL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms